腫瘤是全球人類死亡的重要原因。據(jù)預(yù)測，僅在2020年，全球就有約2000萬新診斷的腫瘤患者和約1000萬例死亡案例。盡管臨床對某些腫瘤的治療效果已顯著改善，但大多數(shù)腫瘤患者的預(yù)后并不理想。診斷延遲是腫瘤患者預(yù)后不良的根本原因，腫瘤常被診斷為晚期。因此，臨床應(yīng)將工作重點放在各種類型腫瘤的預(yù)后和腫瘤狀態(tài)相關(guān)標(biāo)志物診斷上。

      S期激酶相關(guān)蛋白2（SKP2）基因位于人5號染色體的5p13.2號染色體上。SKP2 由于其重要的功能，如參與細(xì)胞周期調(diào)控，具有顯著的致癌特性。SKP2 的致癌特性已在多項小鼠實驗中得到驗證，這凸顯了該基因在靶向治療中的潛力。此外，在各種癌癥中，SKP2 在癌癥組織中的表達差異與對照組織不同。例如，在乳腺癌和前列腺癌中，SKP2 表達升高及其與不良預(yù)后相關(guān)。細(xì)胞實驗也支持 SKP2 在促進癌癥進展中的作用。然而，目前尚無關(guān)于 SKP2 在泛癌中治療的報道。此外，SKP2 的潛在臨床意義（例如，區(qū)分腫瘤患者與非癌癥患者）以及該基因在多種腫瘤中的免疫相關(guān)性尚不清楚。

方法學(xué)

      入組來自多個來源的19,515個樣本，通過Kruskal-Wallis檢驗和Wilcoxon秩和檢驗鑒定實驗組和多個對照組的 SKP2差異表達。通過單因素Cox回歸分析和Kaplan-Meier曲線評估 SKP2 在腫瘤患者中的預(yù)后意義。利用曲線下面積檢測 SKP2 預(yù)測癌癥狀態(tài)的準(zhǔn)確性。在所有相關(guān)分析中都計算了 Spearman 的秩相關(guān)系數(shù)?；蚣患治鲇糜阼b定人類腫瘤中 SKP2 的基本信號通路。

結(jié)論

      在本研究中，15種腫瘤 SKP2 表達上調(diào)，3種腫瘤 SKP2 表達降低（p< 0.05）。轉(zhuǎn)錄因子Forkhead Box M1可能有助于某些腫瘤中SKP2的表達水平升高。過表達的 SKP2 是大多數(shù)癌癥患者預(yù)后的危險因素（風(fēng)險比>1，p<0.05）。SKP2 的表達能夠區(qū)分21種腫瘤的腫瘤和其對照組織（靈敏度= 0.79，特異性= 0.87，曲線下面積= 0.90），這意味著它具有腫瘤方面的診斷潛力。此外，本研究還揭示了 SKP2 表達與DNA甲基轉(zhuǎn)移酶、錯配修復(fù)基因、微衛(wèi)星不穩(wěn)定性、腫瘤突變負(fù)荷、新抗原計數(shù)和免疫的密切關(guān)聯(lián)。

結(jié)果 1 SKP2 在腫瘤組織中的表達差異

      對于大多數(shù)癌癥，癌癥組和對照組的年齡和性別分布均衡（p > 0.05）。檢測到不同的人類器官具有不同的 SKP2 表達水平（p < 0.05）;例如，觀察到子宮頸和心臟分別增加和減少 SKP2 表達水平（如下圖A）。同樣，在不同的腫瘤細(xì)胞系中檢測到不同的 SKP2 表達（p <0.05）（如下圖B），在21種研究腫瘤的18種組織中也發(fā)現(xiàn)了這種現(xiàn)象—15種腫瘤（膀胱尿路上皮癌{ BLCA}等）的 SKP2 表達高，三種腫瘤KICH（腎嫌色細(xì)胞癌）、PRAD（前列腺腺癌）和THCA（甲狀腺癌）的 SKP2 表達低（如下圖C)。

      同時，COAD(結(jié)腸腺癌)、LIHC(肝細(xì)胞癌)和UCEC（子宮體子宮內(nèi)膜癌）組的老年（≥65歲）和年輕（<65歲）的 SKP2 表達水平均高于對照組（p <0.05）；BLCA及其對照組之間的性別分布也不平衡（p < 0.05），而進一步調(diào)整試驗，BLCA實驗組的 SKP2 表達水平升高（p < 0.05）。因此，與對照組織相比，SKP2 在大多數(shù)癌癥中的mRNA表達存在顯著差異。

      除了mRNA水平外，本文還在蛋白質(zhì)水平上評估了 SKP2 在各種癌癥及其對照組織中的表達。對于CESC、COAD、HNSCC、腎癌、LIHC、LUAD、LUSC、STAD和UCEC，與正常組織相比，抗 SKP2 抗體在癌癥組織中的染色強度明顯更強（下圖A）；而在THCA中研究了相反的趨勢（下圖A）。此外，通過統(tǒng)計分析證實了CESC、COAD和STAD中 SKP2 蛋白水平的增加（p < 0.05），這與mRNA水平的結(jié)果一致。盡管在其他九種腫瘤（例如BLCA）的癌癥組織和對照組織之間沒有發(fā)現(xiàn) SKP2 蛋白水平的顯著差異，但大多數(shù)這些腫瘤的 SKP2 在蛋白質(zhì)和mRNA水平上的表達表現(xiàn)出相同的趨勢。

結(jié)果 2 不同 SKP2 表達水平患者的臨床特征

      具有不同臨床特征的患者可能有不同的預(yù)后。本文分析了 SKP2 表達與患者現(xiàn)有臨床特征數(shù)據(jù)之間的關(guān)系。結(jié)果顯示，在某些腫瘤的晚期AJCC階段，SKP2表達增加（p < 0.05）（下圖A）。在患有HNSCC、LAML 或 READ（直腸腺癌）的男性而非女性患者中觀察到 SKP2 表達升高；相比之下，在KIRP（腎狀細(xì)胞癌）和SARC（肉瘤）中發(fā)現(xiàn)了相反的現(xiàn)象（p < 0.05）。不同年齡的癌癥患者表現(xiàn)出不同水平的 SKP2 表達。例如，在老年BRCA（乳腺浸潤性癌）患者和PCPG（嗜鉻細(xì)胞瘤和副神經(jīng)節(jié)瘤）年輕患者中也檢測到 SKP2 表達降低（p < 0.05）。

      鑒于 SKP2 表達與五種腫瘤（BRCA、KIRP、LIHC、LUAD 和 READ）中至少兩個臨床特征相關(guān)，因此對這些腫瘤進行了協(xié)變量分析。對于處于 AJCC 一期的癌癥患者，觀察到男性的 SKP2 表達低于女性（下圖B)；而在 II、III 或 IV 階段的KIRP中未發(fā)現(xiàn)這種差異。對于 KIRP，SKP2 表達與AJCC分期之間的正相關(guān)不是針對女性，而是針對男性 （p < 0.05） （下圖C）。

結(jié)果 3 不同 SKP2 表達水平的患者的預(yù)后差異

      為了直接評估 SKP2 表達在各種腫瘤中的預(yù)后意義，本研究進行了單因素Cox回歸分析和Kaplan-Meier曲線分析。兩種分析方法一致表明，對于 ACC（腎上腺皮質(zhì)癌）、KICH、KIRP、LGG（腦低級別膠質(zhì)瘤）、LIHC、MESO（間皮瘤）、PRAD、SKCM（皮膚黑色素瘤）或THCA（風(fēng)險比 [HR]>1，p<0.05）患者，SKP2 表達升高代表OS和/或DSS較差，而OV（卵巢漿液性囊腺癌）患者的OS和 DSS較好，READ或THYM（胸腺瘤）（HR<1）。在DFI和PFI中，SKP2 表達對ACC和KIRP患者也起著危險作用（HR>1，p<0.05）（下圖A-D）。此外，SKP2 表達與KICH、LGG、LIHC、MESO 或 UVM（葡萄膜黑色素瘤）患者的PFI差顯著相關(guān)（HR>1，p<0.05），以及OV患者的PFI顯著相關(guān)（HR<1，p<0.05）（下圖B和D）。

結(jié)果 4 SKP2 表達水平具有腫瘤診斷價值

      SKP2 在各種癌癥中的表達預(yù)后意義顯著，但尚不清楚 SKP2 是否能區(qū)分癌癥樣本和對照樣本，本研究對此進行了分析。在本文研究的21種腫瘤中，SKP2 很好地區(qū)分了15種腫瘤（BLCA等）組織及其正常對應(yīng)物（AUC > 0.75）（如下圖A）。特別是，SKP2 表達具有顯著的區(qū)分8種癌癥與對照組織的能力；8種腫瘤分別為BLCA、CESC、COAD、ESCA（食管癌）、GBM（多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤）、LUSC、PCPG（嗜鉻細(xì)胞瘤和副神經(jīng)節(jié)瘤）和READ（AUC > 0.90）（如下圖A）。SKP2 的表達使辨別21種癌癥的腫瘤和對照組織成為可能（靈敏度= 0.79，特異性=0.87，AUC = 0.90）（如下圖B），特別是對于上面列出的15種癌癥（敏感性= 0.83，特異性 = 0.91，AUC = 0.94）（如下圖C)。

結(jié)果 5 具有 DNMT、MMRG、MSI 和 TMB 患者的 SKP2 表達

      DNMT、MMRGs、MSI和TMB被認(rèn)為是癌癥的預(yù)后標(biāo)志物和治療指標(biāo)。探索 SKP2 與這些指標(biāo)之間的關(guān)系可能有助于確定 SKP2 在腫瘤中的標(biāo)志物作用。在幾乎所有分析的33種癌癥中，SKP2 表達與3種DNMT和5種MMRG的表達水平之間存在顯著正相關(guān)（下圖A 和B）。在多種腫瘤中也觀察到 SKP2 表達與MSI和TMB的密切關(guān)聯(lián)，尤其是MSI中的DLBC（淋巴樣腫瘤彌漫性B細(xì)胞淋巴瘤）（ρ =−0.51，p < 0.05）（ 下圖C），以及TMB中的KICH、LUAD（肺腺癌）和READ（ρ > 0.3， p < 0.05）（下圖D）。這些結(jié)果表明，SKP2 可能通過影響DNMTs、MMRGs、MSIs和TMBs來影響腫瘤的進展。

參考文獻

Li GS, Huang T, Zhou HF. Gene S-phase kinase associated protein 2 is a novel prognostic marker in human neoplasms. BMC Med Genomics. 2023 Jun 12;16(1):128.