近年來(lái),隨著我國(guó)醫(yī)療水平不斷完善,最新研究發(fā)現(xiàn),病原微生物宏基因組二代測(cè)序(mNGS)在感染性疾病檢測(cè)中可獲得顯著價(jià)值,其能夠在未依賴(lài)預(yù)知病原體前提下,獲得不同病原微生物的基因序列實(shí)施鑒定,且能夠快速分辨出病毒、真菌、細(xì)菌以及寄生蟲(chóng),甚至可反映新型病原微生物,進(jìn)而為臨床抗感染提出針對(duì)性指導(dǎo)作用。
圖片來(lái)源:Small Methods . 2021 Jan 4;5(1):2000792.
一、概述
病原宏基因組二代測(cè)序(mNGS)是不基于培養(yǎng),直接從環(huán)境/臨床樣品中提取全部微生物的DNA,利用基因組學(xué)的研究策略研究環(huán)境樣品中所包含的全部微生物的遺傳組成及其群落功能,可廣泛分析臨床樣本微生物組(細(xì)菌、真菌、病毒)的高通量測(cè)序方法。mNGS技術(shù)對(duì)免疫抑制人群和重癥感染人群的病原學(xué)診斷起到了突破性作用。其優(yōu)點(diǎn)在于不需要培養(yǎng),不需要前提假設(shè),能夠基本達(dá)到對(duì)細(xì)菌、病毒、真菌和寄生蟲(chóng)等所有已知基因序列的病原微生物全覆蓋,且具有檢測(cè)新發(fā)病原體和罕見(jiàn)病原的能力。
近年來(lái)感染類(lèi)疾病相關(guān)研究舉例:
圖片來(lái)源:High-Throughput Metagenomics for Identification of Pathogens in the Clinical Settings.
二、臨床應(yīng)用
病原微生物宏基因組目前主流臨床適用場(chǎng)景:
1、患者表現(xiàn)為發(fā)熱或發(fā)熱癥候群,病因未明確(符合不明原因發(fā)熱定義),考慮感染或不除外感染,但規(guī)范性經(jīng)驗(yàn)抗感染治療無(wú)效,在應(yīng)用常規(guī)技術(shù)檢測(cè)的基礎(chǔ)上,開(kāi)展mNGS產(chǎn)品檢測(cè)。
2、各種原因?qū)е禄颊呒蔽V匕Y表現(xiàn),不除外感染所致,或考慮繼發(fā)或并發(fā)危及生命的嚴(yán)重感染,在常規(guī)檢測(cè)的基礎(chǔ)上,開(kāi)展mNGS產(chǎn)品檢測(cè)。
3、免疫受損患者疑似繼發(fā)感染,常規(guī)病原學(xué)檢查未能明確致病原或/和規(guī)范性經(jīng)驗(yàn)抗感染治療無(wú)效,建議進(jìn)一步完善常規(guī)病原學(xué)檢測(cè)的同時(shí),或在其基礎(chǔ)上,開(kāi)展mNGS產(chǎn)品檢測(cè)。
4、疑似局部感染,病原學(xué)診斷未明確、不及時(shí)處理則后果嚴(yán)重時(shí),在常規(guī)檢測(cè)的基礎(chǔ)上,開(kāi)展mNGS產(chǎn)品檢測(cè)。
5、高度疑似感染性疾病,但病原學(xué)診斷未明確且常規(guī)抗感染治療無(wú)效,建議進(jìn)一步完善常規(guī)病原學(xué)檢測(cè)、處理原發(fā)感染灶,調(diào)整經(jīng)驗(yàn)抗微生物治療方案的同時(shí)開(kāi)展mNGS檢測(cè)。
6、慢性感染,或慢性疾病不除外感染,尤其是二者臨床表現(xiàn)相似、難以鑒別時(shí),病情嚴(yán)重或抗感染治療療效不佳需要明確病因,建議在完善常規(guī)檢測(cè)、調(diào)整經(jīng)驗(yàn)治療的同時(shí)開(kāi)展mNGS產(chǎn)品檢測(cè)。
7、其他患者疑似特殊病原體感染或從相關(guān)流行病學(xué)角度考慮需要進(jìn)行mNGS產(chǎn)品檢測(cè)。
三、華測(cè)mNGS(DNA+RNA)檢測(cè)項(xiàng)目
我們緊跟臨床痛點(diǎn),全新優(yōu)化升級(jí)病原微生物宏基因組檢測(cè)套餐,DNA+RNA雙通道更全面助力感染病原體快速診斷。
項(xiàng)目簡(jiǎn)介
本項(xiàng)目采用病原宏基因組(mNGS)分析檢測(cè)技術(shù),該技術(shù)基于 Illumina 高通量測(cè)序技術(shù),并利用生物信息學(xué)方法進(jìn)行分析,覆蓋 20000+病原體。與傳統(tǒng)方法相比,本項(xiàng)目具有無(wú)偏倚、高效率、廣覆蓋等特點(diǎn),是一種新的不依賴(lài)傳統(tǒng)微生物培養(yǎng)而廣泛分析臨床樣本中微生物組(細(xì)菌、真菌、病毒、寄生蟲(chóng))的高通量測(cè)序方法。本檢測(cè)適用于不明原因發(fā)熱、疑難危重、中樞神經(jīng)系統(tǒng)、呼吸道等感染患者。DNA+RNA檢測(cè)流程:當(dāng)感染類(lèi)型難以明確時(shí),可全面覆蓋DNA病原體與RNA病毒。
產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)
穩(wěn)丨標(biāo)準(zhǔn)化實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量管理體系,檢測(cè)穩(wěn)定可靠
全丨全面的檢測(cè)流程,病原種類(lèi)全覆蓋
高丨高測(cè)序數(shù)據(jù)量,帶來(lái)病原檢測(cè)高敏感性
準(zhǔn)丨臨床級(jí)別數(shù)據(jù)庫(kù)和核心智能算法,結(jié)果精準(zhǔn)
樣本要求
參考文獻(xiàn)
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